Atom é um poderoso robô criado pelo chefe do Ministério da Ciência, Dr. Tenma, para substituir seu filho Tobio, que havia falecido em um acidente automobilístico. Dr. Tenma logo percebeu que aquele pequeno androide não poderia preencher o vazio da perda de seu filho, rejeitou o robô e acabou vendendo-o para um dono de circo cruel chamado Hamegg. Algum tempo depois o Professor Ochanomizu, o novo chefe do Ministério da Ciência, após alguns empecilhos consegue a tutela de Atom. Logo ele percebeu que Atom era dotado de poderes e habilidades superiores, e também da capacidade de expressar emoções humanas. Atom então começa a combater crimes, o mal e a injustiça.
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Sequência de: Atom: The Beginning
